More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2172 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 406 aa  836    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.23 
 
 		 986 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  51.88 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  44.86 
 
 		 917 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 771 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 653 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  45.05 
 
 		 597 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  44.32 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  44.32 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 		 584 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 604 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 		 609 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  46.95 
 
 		 560 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  46.95 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  36.19 
 
 		 779 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  47.39 
 
 		 590 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  43.45 
 
 		 608 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 584 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 620 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  43.38 
 
 		 598 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  44.81 
 
 		 774 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  42.91 
 
 		 572 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  42.53 
 
 		 572 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  43.33 
 
 		 575 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  42.65 
 
 		 596 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  42.8 
 
 		 578 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  42.44 
 
 		 578 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 536 aa  222  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  41.31 
 
 		 578 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 552 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 1085 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 525 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  41.2 
 
 		 550 aa  212  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  44 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 681 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 861 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 686 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 701 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 685 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 671 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  35.8 
 
 		 692 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  28.19 
 
 		 1379 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  35.57 
 
 		 654 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  29.13 
 
 		 675 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 744 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.34 
 
 		 819 aa  156  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 675 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.61 
 
 		 1258 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.3 
 
 		 833 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 614 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 756 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 826 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 819 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 655 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  35.74 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 672 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 702 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 1089 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 		 801 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 1146 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 673 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  26.96 
 
 		 1258 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 683 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 1262 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 760 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 683 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 713 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 674 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 1134 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  32.75 
 
 		 505 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 467 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 		 990 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  33.72 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 1079 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1072 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.95 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.95 
 
 		 638 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 683 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  28.74 
 
 		 844 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.74 
 
 		 1808 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  33.22 
 
 		 1850 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1394  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 786 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.462378  normal  0.162858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.7 
 
 		 627 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 467 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 1080 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 688 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1108 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 659 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 1113 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 785 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 		 695 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 642 aa  133  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 804 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>