More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3526 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.81 
 
 		 609 aa  686    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  67.59 
 
 		 590 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.98 
 
 		 604 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.4 
 
 		 584 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  64.33 
 
 		 540 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  62.37 
 
 		 596 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 584 aa  1191    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  63.79 
 
 		 560 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  63.54 
 
 		 598 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  60.26 
 
 		 608 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  58.47 
 
 		 596 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  57.59 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  58.56 
 
 		 575 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  58.38 
 
 		 578 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  57.99 
 
 		 597 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  57.88 
 
 		 578 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  57.49 
 
 		 599 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  57.96 
 
 		 572 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.05 
 
 		 620 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  43.99 
 
 		 578 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  46.21 
 
 		 560 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  52.14 
 
 		 774 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  48.74 
 
 		 779 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 1085 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 		 986 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  42.44 
 
 		 917 aa  241  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  41.11 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 552 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 653 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 780 aa  211  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 1055 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  38.49 
 
 		 550 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 830 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 683 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  37.24 
 
 		 408 aa  171  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  37.24 
 
 		 408 aa  171  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 1146 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 467 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 655 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  38.64 
 
 		 310 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  32.5 
 
 		 1850 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  35.88 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  34.72 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 470 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  27.93 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  35.21 
 
 		 305 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 626 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  32.66 
 
 		 675 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 611 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 701 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 611 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 1021 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  35.53 
 
 		 654 aa  160  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 683 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  30.5 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  34.13 
 
 		 692 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  37.21 
 
 		 502 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  32.92 
 
 		 785 aa  158  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  38.41 
 
 		 681 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  36.14 
 
 		 457 aa  157  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 494 aa  157  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  37.58 
 
 		 538 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 594 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 678 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 589 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 785 aa  156  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  37.58 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  37.58 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 602 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.22 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1047 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  38.1 
 
 		 600 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1047 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 713 aa  153  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 662 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  37.25 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  37.25 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>