More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3623 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  63.03 
 
 
590 aa  700    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  73.45 
 
 
572 aa  828    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  73.64 
 
 
572 aa  857    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.17 
 
 
604 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
620 aa  1280    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  55.98 
 
 
598 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.45 
 
 
609 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  54.87 
 
 
608 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
584 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  53.85 
 
 
596 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.05 
 
 
584 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  56.2 
 
 
540 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  55.51 
 
 
560 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  50.91 
 
 
578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  50 
 
 
578 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  50.74 
 
 
575 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  47.78 
 
 
596 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  47.04 
 
 
597 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  46.68 
 
 
599 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  45.02 
 
 
578 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  46.9 
 
 
560 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  47.86 
 
 
774 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  49.8 
 
 
779 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
536 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
406 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 
986 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
1085 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  42.91 
 
 
524 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
771 aa  217  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  41.77 
 
 
917 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1055 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
653 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
780 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  39.03 
 
 
830 aa  190  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  40.16 
 
 
550 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
552 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
655 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  36.94 
 
 
675 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  38.43 
 
 
692 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  36.8 
 
 
654 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
710 aa  170  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  37.23 
 
 
505 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
467 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
701 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
1465 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
1021 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  37.58 
 
 
433 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
470 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1047 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
713 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1047 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
683 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
683 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
678 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
392 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
524 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
1146 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
467 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  31.21 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  31.21 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  37.07 
 
 
310 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  37.25 
 
 
371 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
480 aa  148  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
674 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
553 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  34.03 
 
 
308 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  33.9 
 
 
785 aa  146  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
557 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
528 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
566 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  33.89 
 
 
611 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
641 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.97 
 
 
541 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
560 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  31.93 
 
 
436 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  33.45 
 
 
315 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  36.97 
 
 
693 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
458 aa  145  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
785 aa  145  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
588 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
679 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
675 aa  144  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
611 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
611 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  34.52 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
971 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  35.36 
 
 
912 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33 
 
 
1036 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  32.89 
 
 
1850 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  35.55 
 
 
730 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  32.86 
 
 
305 aa  140  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  31.69 
 
 
406 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.03 
 
 
681 aa  140  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
448 aa  140  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
970 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
486 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
673 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>