More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1960 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 525 aa  1066    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 		 528 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  44.15 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 406 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  43.12 
 
 		 524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 667 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 986 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 584 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 771 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  36.33 
 
 		 596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  32.7 
 
 		 917 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  38.81 
 
 		 598 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  36.93 
 
 		 597 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  36.93 
 
 		 599 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  38.06 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 604 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  38.55 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  35.89 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  35.89 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  37.06 
 
 		 578 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 609 aa  177  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  37.88 
 
 		 608 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  37.06 
 
 		 575 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  36.71 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 653 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  35.27 
 
 		 578 aa  173  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  36.11 
 
 		 572 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  35.41 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.2 
 
 		 777 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1085 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 774 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 662 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  29.92 
 
 		 673 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 516 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 655 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  33.33 
 
 		 779 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 674 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.69 
 
 		 541 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 592 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  31.44 
 
 		 592 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 970 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  32.29 
 
 		 600 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 570 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 656 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 691 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 661 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  35.07 
 
 		 654 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  29.31 
 
 		 560 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  30.53 
 
 		 672 aa  136  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  26.22 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 655 aa  134  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 586 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  31.98 
 
 		 676 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 655 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 671 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  29.27 
 
 		 490 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 473 aa  133  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 739 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  28.92 
 
 		 661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 656 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 659 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  26.42 
 
 		 654 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  29.09 
 
 		 656 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  27.68 
 
 		 502 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 408 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  32.36 
 
 		 692 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 507 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  32.92 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 801 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  25.88 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  30.72 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.6 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  32.57 
 
 		 363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  31.39 
 
 		 675 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  32.2 
 
 		 613 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 516 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 683 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>