More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3324 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 408 aa  845    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  47.77 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  43.86 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 641 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 560 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  32.45 
 
 		 1092 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 552 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 557 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 862 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 852 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 682 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  40.08 
 
 		 673 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 662 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 970 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1145  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 714 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 552 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  38.91 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.12 
 
 		 1255 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  39.54 
 
 		 647 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 844 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  29.64 
 
 		 742 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.3 
 
 		 674 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  39.29 
 
 		 592 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 701 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  41.35 
 
 		 591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 1021 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 1146 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 852 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 671 aa  163  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 766 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 691 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 726 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 553 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  39.58 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 850 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 570 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  28.73 
 
 		 556 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 659 aa  159  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 850 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 551 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 495 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 770 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 683 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 766 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 801 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 588 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 713 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  34.04 
 
 		 608 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 853 aa  156  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 591 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  35.57 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 819 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.14 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 642 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 753 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  34.04 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.04 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1260 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 678 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  34.04 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  34.04 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  34.04 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.13 
 
 		 819 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 619 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  28.72 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 983 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 848 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  36.36 
 
 		 661 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 551 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 1260 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 586 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  31.81 
 
 		 774 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 777 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 683 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 661 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 703 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 611 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 611 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.32 
 
 		 578 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 800 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 677 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>