More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1222 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.67 
 
 
683 aa  794    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
686 aa  1405    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.84 
 
 
671 aa  733    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.12 
 
 
702 aa  887    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  73.98 
 
 
672 aa  1009    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
826 aa  277  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
861 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
756 aa  261  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
760 aa  253  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
677 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
711 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
702 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
587 aa  197  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.58 
 
 
819 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  31.13 
 
 
524 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
801 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1108 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
819 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
570 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
559 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1113 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
831 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 
763 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  38.43 
 
 
554 aa  171  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
584 aa  171  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
503 aa  171  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.57 
 
 
1255 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
804 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
871 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
607 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
557 aa  167  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  30.81 
 
 
1112 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  30.1 
 
 
917 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.81 
 
 
952 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
559 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
639 aa  165  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
707 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
953 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
406 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
822 aa  164  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
885 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
653 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  29.56 
 
 
844 aa  162  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  39.68 
 
 
313 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
495 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
576 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
540 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
645 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
744 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
560 aa  160  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
557 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.83 
 
 
627 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.83 
 
 
638 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
552 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.83 
 
 
627 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.42 
 
 
641 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.79 
 
 
1081 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
643 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
970 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1079 aa  157  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
557 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
552 aa  157  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  35.52 
 
 
899 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
773 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
1053 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
518 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
736 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
774 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  34.83 
 
 
907 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.19 
 
 
631 aa  154  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
803 aa  154  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
1076 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
862 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
919 aa  154  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
1428 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
873 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  36.55 
 
 
552 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
859 aa  153  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
921 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  29.47 
 
 
556 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
394 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  31.88 
 
 
887 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
642 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
501 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
522 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
384 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0793424  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
753 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1799  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
1150 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  28.92 
 
 
410 aa  152  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
552 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
552 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
395 aa  151  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0991  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.05 
 
 
607 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.964598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 
1050 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
577 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  36.08 
 
 
591 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
588 aa  150  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>