More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1659 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
384 aa  790    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0793424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
522 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
645 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
793 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.29 
 
 
639 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.25 
 
 
953 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
849 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
819 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  40.1 
 
 
733 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  45.05 
 
 
1561 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
642 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 
642 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
859 aa  215  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
853 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
661 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
551 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.18 
 
 
857 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
1113 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1108 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.96 
 
 
1132 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  47.47 
 
 
749 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
847 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  47.21 
 
 
945 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
725 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
845 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 
751 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.88 
 
 
557 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
864 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 
663 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
983 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  46.84 
 
 
945 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 
650 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  36.51 
 
 
1112 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
828 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
955 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  42.7 
 
 
866 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 
766 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
796 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
643 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
677 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
845 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
803 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
518 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 
692 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
1279 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  46 
 
 
839 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
1047 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.4 
 
 
641 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.81 
 
 
692 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
664 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1079 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
657 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 
874 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1225 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
796 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
1047 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  38.87 
 
 
1225 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
673 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
955 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 
753 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
850 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  38.33 
 
 
525 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  42.18 
 
 
533 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
632 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.53 
 
 
933 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
1176 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 
853 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  43.31 
 
 
533 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
752 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  35.91 
 
 
828 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
680 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  44.05 
 
 
892 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
840 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
1050 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
831 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
713 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
637 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7127  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 
782 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612446  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  35.37 
 
 
1015 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  46.13 
 
 
872 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  34.84 
 
 
895 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
1021 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
660 aa  196  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  43.08 
 
 
417 aa  195  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.54 
 
 
824 aa  195  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
649 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1115 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
559 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
774 aa  193  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 
701 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
793 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
954 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
668 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
853 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
1106 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  44.21 
 
 
695 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 
696 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
1102 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
773 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
656 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>