More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1799 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1799  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1150 aa  2365    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.31 
 
 
834 aa  313  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
684 aa  289  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00117415  normal  0.649977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.97 
 
 
925 aa  194  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55 
 
 
823 aa  193  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1124 aa  192  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
1122 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1177  GAF sensor signal transduction histidine kinase  62.18 
 
 
613 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.07 
 
 
1126 aa  172  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
1050 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
683 aa  161  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 
849 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.101601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
672 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.33 
 
 
990 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
686 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
1062 aa  151  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
698 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2227  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
665 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.670404  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
1040 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.75 
 
 
953 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  44.81 
 
 
982 aa  149  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  52.24 
 
 
844 aa  148  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.44 
 
 
1432 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 
1344 aa  148  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.11 
 
 
819 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  24.11 
 
 
1061 aa  145  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
817 aa  144  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.2 
 
 
1148 aa  144  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.17 
 
 
1222 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.3 
 
 
1051 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 
1120 aa  144  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
408 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 
826 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
760 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 
1418 aa  141  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  26.97 
 
 
830 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  23.34 
 
 
899 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
713 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 
819 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.42 
 
 
1116 aa  138  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
756 aa  138  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 
861 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
859 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  22.33 
 
 
921 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
671 aa  135  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  31.34 
 
 
556 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  23.3 
 
 
907 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 
1021 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 
712 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
560 aa  133  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
707 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
654 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
630 aa  131  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.4 
 
 
1258 aa  131  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.8 
 
 
1134 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 
1260 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  25.77 
 
 
774 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
1021 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  21.93 
 
 
833 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  22.9 
 
 
812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.84 
 
 
1108 aa  129  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
557 aa  129  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 
804 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
552 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
516 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1260 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
673 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.21 
 
 
510 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
630 aa  129  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 
801 aa  128  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 
897 aa  128  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.3 
 
 
789 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
641 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
1029 aa  127  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
653 aa  127  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.51 
 
 
1247 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
596 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  26.24 
 
 
779 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
1058 aa  127  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  31.54 
 
 
394 aa  126  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
395 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
681 aa  126  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.34 
 
 
1113 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 
1509 aa  125  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
552 aa  125  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
459 aa  125  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
584 aa  125  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.21 
 
 
1102 aa  124  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
570 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.7 
 
 
823 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
871 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
467 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  26.6 
 
 
596 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
800 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
588 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.76 
 
 
905 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
584 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>