More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2790 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  100 
 
 		 398 aa  813    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  75.44 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  75.44 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  33.84 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  35.22 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  33.76 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  32.02 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  32.02 
 
 		 423 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  30.79 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  31.44 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  28.84 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 421 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  30.03 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  25.99 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  25.08 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  29.07 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  25.08 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  52.43 
 
 		 123 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 143 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  25.32 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 165 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 133 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 152 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 133 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 130 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 133 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 137 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  36.21 
 
 		 136 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  36.21 
 
 		 136 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  37.21 
 
 		 1127 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 133 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  35.4 
 
 		 117 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1128 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 133 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 138 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  36.8 
 
 		 1111 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 161 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 138 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  34.45 
 
 		 135 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 130 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 134 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  34.15 
 
 		 179 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 129 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  36.52 
 
 		 136 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  34.96 
 
 		 160 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 131 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  33.61 
 
 		 135 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  33.61 
 
 		 135 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 138 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 167 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.05 
 
 		 132 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  32.48 
 
 		 141 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 132 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 135 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  30.51 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 1177 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  30 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 132 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 125 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 132 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  28.95 
 
 		 132 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1956  response regulator receiver protein  29.26 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.942882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 566 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 941 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 1133 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  29.03 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.09 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 579 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2999  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.669597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 1832 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>