More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3775 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  45.36 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  36.91 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  34.05 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  34.05 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 417 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 417 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  26.76 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  28.91 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  26.37 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  29.18 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  26.76 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  26.29 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 143 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 347 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 123 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 455 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  22.55 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  22.28 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 130 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  37.69 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 345 aa  96.3  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  33.91 
 
 		 125 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 130 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 161 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 125 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 165 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 132 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 152 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  32.19 
 
 		 160 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  32.14 
 
 		 132 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 145 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  23.79 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  34.96 
 
 		 136 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  33.63 
 
 		 117 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  34.53 
 
 		 1128 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  34.78 
 
 		 141 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 137 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 138 aa  89.7  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 135 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  32.48 
 
 		 136 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  32.48 
 
 		 136 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 138 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 138 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  33.09 
 
 		 1111 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 129 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 133 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 133 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  32.06 
 
 		 179 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 367 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 134 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 147 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.83 
 
 		 1177 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 132 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 135 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  30.77 
 
 		 135 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  30.77 
 
 		 135 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 133 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 136 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  31.62 
 
 		 135 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 130 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 		 131 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 130 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 144 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.17 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  32.09 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  34.19 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  33.33 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  35.71 
 
 		 312 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  29.32 
 
 		 1127 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>