More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4344 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  100 
 
 
391 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  99.49 
 
 
391 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  34.24 
 
 
382 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  27.03 
 
 
414 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
143 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  31.46 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  26.91 
 
 
417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  24.13 
 
 
398 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  35.2 
 
 
388 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  24.13 
 
 
399 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  24.13 
 
 
399 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  35.88 
 
 
423 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  35.88 
 
 
423 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
384 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  36.55 
 
 
347 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  22.6 
 
 
412 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
421 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  37.1 
 
 
347 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  22.28 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  22.67 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 
457 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
455 aa  96.3  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  26.17 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  26.17 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 
381 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  30.08 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 
1758 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
130 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  32.69 
 
 
123 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
2022 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
2026 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
2026 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.86 
 
 
1992 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  28.8 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
2137 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
2539 aa  83.2  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  33.62 
 
 
136 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
129 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
944 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 
132 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  32.06 
 
 
1888 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  32.31 
 
 
1970 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  25.38 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  21.68 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  28.1 
 
 
133 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  28.1 
 
 
133 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  29.57 
 
 
125 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  31.4 
 
 
136 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  32.14 
 
 
132 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  31.62 
 
 
132 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  29.2 
 
 
133 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  30.36 
 
 
117 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
130 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
130 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  21.68 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
1647 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 
125 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1646 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
1907 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1646 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 
1987 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  32.46 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
2164 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 
2070 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  29.2 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  29.2 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
1629 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  29.69 
 
 
1983 aa  79.7  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  30.16 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  30.09 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  29.57 
 
 
133 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 
130 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
144 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 
134 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
2423 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.04 
 
 
1131 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  35.25 
 
 
160 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  32.31 
 
 
2458 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.25 
 
 
941 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
133 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  30.97 
 
 
138 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
2414 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  32.31 
 
 
2476 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  31.86 
 
 
141 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  30.09 
 
 
135 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 
131 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  32.26 
 
 
1989 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  30.09 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  31.4 
 
 
128 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  31.58 
 
 
128 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  31.4 
 
 
128 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 
132 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.18 
 
 
1971 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.06 
 
 
1956 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>