More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3899 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  100 
 
 		 136 aa  279  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  84.3 
 
 		 133 aa  216  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  79.2 
 
 		 130 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  81.15 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  81.58 
 
 		 145 aa  203  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  78.95 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  72.27 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  70.59 
 
 		 132 aa  190  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  67.44 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  72.65 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  70.63 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  67.2 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  71.31 
 
 		 133 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  69.35 
 
 		 165 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  70.94 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  69.35 
 
 		 152 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  71.19 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  69.42 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  68.03 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  68.46 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  68.03 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  68 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  68 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  69.23 
 
 		 161 aa  183  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  71.55 
 
 		 134 aa  183  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  71.79 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  71.79 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  70.94 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  70.94 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  69.42 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  69.49 
 
 		 167 aa  180  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 133 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  71.93 
 
 		 117 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  67.23 
 
 		 132 aa  177  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  65.29 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  67.24 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  64.34 
 
 		 135 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  65.81 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  60 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 2539 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 414 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 1646 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 1646 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 2423 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 1647 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 1629 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 405 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 405 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 1758 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36 
 
 		 1992 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 417 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  34.4 
 
 		 1987 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 347 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 405 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  37.39 
 
 		 2458 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  37.39 
 
 		 2476 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 347 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 227 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  38.26 
 
 		 2092 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.34 
 
 		 1971 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  38.66 
 
 		 352 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  40.34 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 382 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.39 
 
 		 1888 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 457 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 246 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  34.65 
 
 		 412 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 421 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.52 
 
 		 2301 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1974 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.79 
 
 		 1866 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 427 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.29 
 
 		 2336 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 1832 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 235 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 227 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  38.39 
 
 		 1989 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 2137 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  33.91 
 
 		 2070 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 394 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.39 
 
 		 1956 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>