More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4992 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  98.5 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  95.49 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  82.31 
 
 		 134 aa  220  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  78.36 
 
 		 136 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  78.36 
 
 		 136 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  75.94 
 
 		 135 aa  209  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  77.34 
 
 		 135 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  77.34 
 
 		 135 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 130 aa  202  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  76.98 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  75 
 
 		 131 aa  194  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  74.58 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  70.83 
 
 		 161 aa  193  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  73.73 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  73.73 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  72.88 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  74.78 
 
 		 117 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  74.36 
 
 		 125 aa  189  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  74.36 
 
 		 125 aa  189  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  65.32 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  68.64 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  69.23 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  66.94 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  62.79 
 
 		 138 aa  176  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  63.03 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  62.61 
 
 		 132 aa  166  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  62.07 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  61.74 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 147 aa  164  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  63.16 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  60.8 
 
 		 165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  60.87 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  60.17 
 
 		 179 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  57.38 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  55.12 
 
 		 167 aa  149  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 2539 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 2423 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.84 
 
 		 2458 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.84 
 
 		 2476 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.52 
 
 		 1992 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 414 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 347 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.93 
 
 		 1987 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 1647 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 457 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 405 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 347 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 382 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 1646 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 1646 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 417 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.9 
 
 		 1971 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1832 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 399 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 399 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 398 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 246 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 1974 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 405 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1629 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.97 
 
 		 1029 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 396 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 405 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 396 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 455 aa  95.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  37.4 
 
 		 1834 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 2137 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 231 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  36.52 
 
 		 1888 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 1758 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 421 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 384 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  37.39 
 
 		 1983 aa  93.2  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 1907 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 427 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 1010 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 388 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 381 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 394 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  36.92 
 
 		 527 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.52 
 
 		 337 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 228 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>