More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2400 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  74.8 
 
 		 137 aa  206  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  75.81 
 
 		 161 aa  203  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  70.97 
 
 		 133 aa  200  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  70.08 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  70.08 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 130 aa  197  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  73.11 
 
 		 135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  72.88 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  72.88 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  70.83 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  70.49 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  67.46 
 
 		 131 aa  190  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  70 
 
 		 125 aa  189  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  70.49 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  71.93 
 
 		 117 aa  187  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  70.59 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  68.07 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  68.07 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  67.8 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  63.33 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  61.11 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  62.81 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  60 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  59.54 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  64.96 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  63.56 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  65.52 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  60.33 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 144 aa  159  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  62.28 
 
 		 160 aa  159  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  58.97 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  51.94 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  51.94 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  55.38 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  53.66 
 
 		 179 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 414 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  38.28 
 
 		 412 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 1758 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 417 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 405 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 405 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 2539 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 243 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 246 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 235 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 347 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 421 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 427 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 365 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 236 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  42.2 
 
 		 347 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  36.13 
 
 		 1888 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 1629 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 245 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1832 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 247 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 		 1987 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 243 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.32 
 
 		 337 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 243 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 236 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 244 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  38.76 
 
 		 1834 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 237 aa  97.1  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 225 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 1646 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 1646 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.29 
 
 		 1992 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 242 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 		 457 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 1974 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 382 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 2423 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 245 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 345 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 1647 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 320 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>