More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2046 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2046  response regulator  100 
 
 		 404 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  49.89 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  50 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 321 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  76.98 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  68.6 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  65 
 
 		 476 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  63.64 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 477 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 453 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3476  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0690542  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 503 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  38.98 
 
 		 151 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 231 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 369 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 452 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.87 
 
 		 227 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 225 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35 
 
 		 123 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  35.83 
 
 		 225 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0072  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 934 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 161 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  30.39 
 
 		 224 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 122 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 2212 aa  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  37.9 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 228 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 235 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 127 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.19 
 
 		 240 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 238 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 224 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  26.7 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1559 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  26.11 
 
 		 232 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 576 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  33.33 
 
 		 462 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 280 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 133 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.2 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 133 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  33.61 
 
 		 2301 aa  87  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 225 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.38 
 
 		 229 aa  87  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.26 
 
 		 223 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  35.9 
 
 		 123 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1069  response regulator receiver protein  35 
 
 		 128 aa  86.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0511705  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 238 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 238 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.48 
 
 		 310 aa  86.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 250 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 238 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  35.59 
 
 		 238 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 250 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  35.59 
 
 		 238 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 238 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  35.59 
 
 		 250 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.21 
 
 		 2284 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.34 
 
 		 2301 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 133 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 124 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 159 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  27 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  28.09 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 2539 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 133 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  30.43 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  27.45 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  31.37 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 122 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 124 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  31.37 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  27.45 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>