More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0905 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  100 
 
 
295 aa  587  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1849  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
263 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.58 
 
 
704 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  34.39 
 
 
470 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.46 
 
 
460 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1401  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.34 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.13 
 
 
705 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  34.39 
 
 
470 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  35.37 
 
 
190 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
122 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.3 
 
 
454 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
122 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.85 
 
 
704 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.34 
 
 
444 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713581  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  37.12 
 
 
470 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  34.17 
 
 
705 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  35.03 
 
 
470 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 
121 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.84 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
121 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  32.69 
 
 
236 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
1383 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.7 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
472 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
472 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4410  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.5 
 
 
444 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3995  helix-turn-helix, Fis-type  36.97 
 
 
444 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0385153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  34.39 
 
 
470 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1431 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.56 
 
 
1514 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
869 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.88 
 
 
466 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.56 
 
 
1514 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  35.61 
 
 
469 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
452 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  34.18 
 
 
470 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
566 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
349 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  34.18 
 
 
470 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 
243 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 
243 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  34.18 
 
 
470 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
121 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 
231 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.59 
 
 
123 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4458  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 
442 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.98 
 
 
461 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
1013 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
125 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72720  putative two-component response regulator  29.8 
 
 
447 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.269979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 
356 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
452 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
576 aa  85.9  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 
247 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 
229 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
579 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1042  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.5 
 
 
444 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.77 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0397  nitrogen regulation protein NR(I)  36.43 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  34.59 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
132 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.96 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
1002 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  31.85 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1514  response regulator receiver protein  33.57 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222117  hitchhiker  0.00633337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.85 
 
 
869 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  37.4 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.2 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  31.85 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  34.33 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  31.2 
 
 
132 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3740  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.16 
 
 
454 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0840186  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  29.77 
 
 
235 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
121 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 
234 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  31.78 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>