More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3535 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  100 
 
 
134 aa  268  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  66.67 
 
 
124 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 
123 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  43.22 
 
 
121 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
121 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.46 
 
 
125 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
161 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
121 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
121 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
121 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  38.98 
 
 
121 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
120 aa  100  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
245 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 
231 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
120 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  42.24 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
120 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
167 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  39.13 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
245 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  39.13 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  37.39 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
242 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
127 aa  94.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  38.69 
 
 
242 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 
120 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  44.04 
 
 
233 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  37.07 
 
 
121 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 
345 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
370 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 
123 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
121 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
121 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  42.34 
 
 
1335 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
2212 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 
934 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
2026 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  37.39 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
707 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  36.52 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
123 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  39.34 
 
 
1983 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  35 
 
 
1344 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  39.34 
 
 
2026 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 
225 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  36.7 
 
 
254 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  39.47 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.34 
 
 
240 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  40.95 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  37.19 
 
 
462 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
121 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  40.38 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.97 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  36.13 
 
 
160 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
123 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 
225 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.06 
 
 
464 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  35.83 
 
 
151 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  38.21 
 
 
2070 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
394 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>