More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2212 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  100 
 
 		 128 aa  253  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  72 
 
 		 127 aa  194  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  73.6 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  73.6 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  73.6 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  52.76 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  54.62 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  42.86 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2223  chemotaxis protein CheY  46 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  40.65 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  42.37 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  41.67 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 2539 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  41.73 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  38.66 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  95.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 2423 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  43.59 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  41.53 
 
 		 2301 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  42.37 
 
 		 2284 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 1155 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.27 
 
 		 248 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  40.68 
 
 		 2458 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  40.68 
 
 		 2476 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  35.25 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  37.29 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  37.82 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  37.82 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  38.94 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  37.82 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  39.64 
 
 		 1987 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  40.83 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 1616 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.52 
 
 		 2336 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>