More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2302 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  72 
 
 		 128 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  71.2 
 
 		 125 aa  184  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  71.2 
 
 		 125 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  70.16 
 
 		 125 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  55.74 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  51.35 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  42.86 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 120 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2223  chemotaxis protein CheY  49 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  41.18 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  42.37 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  42.86 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  43.7 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  42.02 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  42.37 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  40.98 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  40.83 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  48.08 
 
 		 832 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  38.66 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  41.18 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 769 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.12 
 
 		 864 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.12 
 
 		 864 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  47.12 
 
 		 864 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.12 
 
 		 864 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  47.12 
 
 		 864 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.12 
 
 		 864 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  38.66 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 1155 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  45.19 
 
 		 769 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 766 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  41.32 
 
 		 2301 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  47.12 
 
 		 1079 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  39.02 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  39.02 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  39.02 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  39.02 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  39.02 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  41.32 
 
 		 2284 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  41.82 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 755 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 767 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>