More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1576 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  94.31 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  93.5 
 
 		 122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  78.86 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  47.15 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  42.62 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  45.08 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  45.08 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  44.92 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  44.72 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  41.46 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  44.35 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  42.62 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 226 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 2137 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  41.46 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  42.15 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  37.3 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 		 865 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 		 865 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  40.16 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  43.09 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  41.32 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  38.68 
 
 		 734 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  40.16 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  39.83 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  40.68 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 1888 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.66 
 
 		 2336 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 974 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 1907 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  39.13 
 
 		 1983 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 748 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  40.78 
 
 		 748 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 977 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 2026 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 239 aa  94  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40.68 
 
 		 2301 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 758 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>