More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2168 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  70 
 
 		 120 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  73.33 
 
 		 120 aa  180  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  69.75 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  68.91 
 
 		 120 aa  176  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  67.23 
 
 		 120 aa  173  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  66.95 
 
 		 121 aa  167  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  66.67 
 
 		 120 aa  166  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 120 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  65.83 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  62.5 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  65.22 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  63.33 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  60.5 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  63.33 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  62.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  61.54 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  60.34 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  59.48 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  59.17 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  57.76 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  57.76 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  58.82 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  58.12 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  55.17 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  56.41 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  58.47 
 
 		 122 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  57.63 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  55 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  55.83 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  55 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  56.67 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  55.56 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  49.58 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  54.24 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  47.9 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  53.45 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  47.9 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  47.86 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  56.52 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  53.33 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  54.17 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  50.41 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  49.19 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  50 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  50 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  49.11 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  48.36 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  51.69 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  49.17 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3973  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.249812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3466  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3451  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  50.86 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  50.86 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4294  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4072  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3796  response regulator receiver protein  49.53 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  50 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>