More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3147 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  87.5 
 
 		 121 aa  216  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  87.5 
 
 		 121 aa  216  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  79.83 
 
 		 121 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2223  chemotaxis protein CheY  73.83 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  64.1 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  50 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  48.65 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  42.5 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  41.67 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  41.67 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  40.52 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  36.44 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  35 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  43.86 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  35 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  43.86 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  36.67 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  38.02 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  40.54 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  38.02 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 266 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  35.04 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 196 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  36.75 
 
 		 1324 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  36.29 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  38.52 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  37.61 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>