More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1456 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  250  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  40.34 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  41.88 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  40.83 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  38.33 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  39.66 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  40.87 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  38.84 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 768 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 777 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  38.26 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  37.74 
 
 		 748 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  35 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  39.17 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 748 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  39.17 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 756 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.68 
 
 		 763 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  37.6 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 719 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 212 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 706 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 758 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  42.24 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  36.67 
 
 		 798 aa  90.5  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>