More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4608 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  61.6 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2050  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000730652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  43.44 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  41.38 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  40.83 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  43.75 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  42.15 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  44.14 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 2414 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 2137 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  38.33 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  41.88 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  39.42 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 688 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  39.13 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  38.98 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  46.79 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  44.55 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 		 764 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  44.44 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  38.98 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  43.24 
 
 		 2092 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  41.59 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  41.07 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  41.07 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  40.71 
 
 		 1888 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.73 
 
 		 316 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  39.29 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 2022 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 2026 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  42.48 
 
 		 2026 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  40.71 
 
 		 2070 aa  87.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  45.05 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  38.33 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  40 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  45.05 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  45.05 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  45.05 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1651 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  40.34 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  41.94 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 1361 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  38.94 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>