More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2326 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  50.41 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  44.44 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2050  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000730652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  43.22 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 755 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 765 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  41.53 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  41.53 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 762 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  42.16 
 
 		 789 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 769 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.8 
 
 		 764 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  40.83 
 
 		 769 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  39.62 
 
 		 793 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 767 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  41.18 
 
 		 764 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  41.18 
 
 		 769 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  45.54 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  42.16 
 
 		 832 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 769 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  42.16 
 
 		 769 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  42.16 
 
 		 769 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  40.83 
 
 		 878 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  42.16 
 
 		 864 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  42.16 
 
 		 864 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  42.16 
 
 		 864 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  42.16 
 
 		 864 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  42.16 
 
 		 864 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  42.16 
 
 		 864 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 769 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 808 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  42.16 
 
 		 1079 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  40.71 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  36.89 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 766 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  40.71 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 688 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.22 
 
 		 763 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  41.44 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 740 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  39.47 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 760 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  38.24 
 
 		 768 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.66 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.07 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  36.36 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  43.52 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 679 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  40.32 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 804 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  36.94 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 2212 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.96 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  36.94 
 
 		 242 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 242 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 1725 aa  87  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 1725 aa  87  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 896 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>