More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4047 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  279  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  279  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  91.24 
 
 		 137 aa  256  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  60.48 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  63.93 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  53.72 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  51.24 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  50.41 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  49.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  50.41 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  51.24 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  51.64 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  48.67 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  50 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  46.28 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  46.28 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  47.5 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  45.38 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  46.67 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  48 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  48 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  45.45 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  45.97 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  47.83 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  45 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  47.5 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  42.15 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  46.22 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  43.65 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  41.32 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  41.6 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  44.63 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  44.63 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  46.09 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  38.02 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  40.83 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  43.44 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  46.3 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>