More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1411 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  52.76 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  55.74 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  52 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  52 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  52 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  42.48 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  96.7  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2223  chemotaxis protein CheY  39.81 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  41.67 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0052  response regulator protein  38.74 
 
 		 299 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  38.52 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.3 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  41.35 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  38.14 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  41.35 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 928 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  38.14 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.8 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  85.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 119 aa  85.9  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.04 
 
 		 1987 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  36.13 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 309 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.04 
 
 		 1992 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  36 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  42.72 
 
 		 1888 aa  84.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 231 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 1155 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  36.13 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  37.82 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.2 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  33.6 
 
 		 497 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.96 
 
 		 1060 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 2539 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 223 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1646 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1646 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1647 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>