More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4831 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  237  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  237  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  93.39 
 
 		 121 aa  225  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  93.33 
 
 		 121 aa  224  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  87.5 
 
 		 121 aa  217  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  84.3 
 
 		 121 aa  206  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3973  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.249812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3466  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3451  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4294  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4072  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  81.67 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4506  response regulator receiver protein  81.67 
 
 		 121 aa  200  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  71.67 
 
 		 121 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  48.28 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  48.28 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  47.46 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  47.46 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  50 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  50 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  44.17 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  45 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  45.76 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  45.08 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  45.83 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  43.7 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 122 aa  96.7  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  40.98 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  41.88 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  38.46 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  38.84 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  37.61 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3796  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  40.34 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  38.66 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 741 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.82 
 
 		 137 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  39.82 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>