More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1205 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  100 
 
 		 123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  59.17 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  59.17 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  56.45 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  57.02 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  53.51 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  43.09 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  42.61 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  45 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  42.28 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  44.63 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  44.74 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  41.13 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  42.5 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 122 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  37.4 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  44.74 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  45 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  44.74 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  43.86 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  42.86 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  44.07 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  44.07 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  44.17 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  44.17 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.5 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  38.52 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  43.09 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  39.5 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.7 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  42.02 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 394 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  36.59 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  45.69 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.67 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>