More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2317 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  246  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  65.83 
 
 		 120 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  61.67 
 
 		 119 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 298 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  58.41 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.92 
 
 		 423 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  39.83 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  42.28 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  43.44 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  44.17 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  42.15 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  42.15 
 
 		 127 aa  91.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  45.05 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  42.62 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  39.17 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  48.11 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.5 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.5 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.5 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  40.5 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  40.5 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  40.5 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  40.83 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>