More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0217 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  246  7e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  67.52 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 298 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  58.12 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  58.41 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  57.76 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 119 aa  106  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  43.86 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  43.7 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  42.86 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  42.5 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  45.13 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  42.02 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  42.02 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 395 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.94 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 386 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  41.6 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  36.44 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  36.44 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  42.2 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  38.79 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  40.37 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  38.46 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  36.44 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  38.79 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>