More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2874 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  49.57 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  47.93 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  47.86 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  49.57 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  49.57 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  49.57 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  48.72 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  47.86 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  47.11 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  45.3 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  52.21 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  47.86 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  47.11 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  52.21 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  46.72 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  46.72 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  46.72 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  46.77 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  47.86 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  46.34 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  44.44 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  47.86 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  47.86 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  47.86 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  47.86 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  45.3 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  47.86 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  46.15 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  46.15 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  46.15 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  44.44 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  44.44 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>