More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0775 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  56.67 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  57.63 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  57.5 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  56.67 
 
 		 124 aa  143  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  56.67 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  56.67 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  55.83 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  57.14 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  56.67 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  57.26 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  55.74 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  55.83 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  55 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  55.83 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  52.5 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  51.67 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  55 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  55 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  53.66 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  53.66 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  53.66 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  52.1 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  54.17 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  55.08 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 127 aa  136  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  54.7 
 
 		 139 aa  136  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  52.5 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  55 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  55.08 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  50.83 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  50.83 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  50.83 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  52.5 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  50 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  51.67 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>