More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1344 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  98.43 
 
 		 127 aa  256  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  96.85 
 
 		 127 aa  253  9e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  96.06 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  96.06 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  94.49 
 
 		 135 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  99.19 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  95.28 
 
 		 127 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  98.37 
 
 		 123 aa  248  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  90.55 
 
 		 131 aa  241  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  90.48 
 
 		 130 aa  239  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  91.27 
 
 		 126 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  90.48 
 
 		 130 aa  238  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  88.98 
 
 		 127 aa  237  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  86.61 
 
 		 127 aa  232  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  90.16 
 
 		 122 aa  229  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  84.92 
 
 		 128 aa  225  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  84.13 
 
 		 139 aa  224  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  84.13 
 
 		 127 aa  223  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  84.25 
 
 		 128 aa  220  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  85.25 
 
 		 126 aa  219  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  84.13 
 
 		 128 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  80.95 
 
 		 128 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  82.54 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  81.75 
 
 		 128 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  84.43 
 
 		 124 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  80.31 
 
 		 127 aa  215  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  81.97 
 
 		 126 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  85.25 
 
 		 124 aa  214  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  80.95 
 
 		 128 aa  214  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  80.16 
 
 		 128 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  81.97 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  81.15 
 
 		 124 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  77.95 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  77.95 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  76.8 
 
 		 133 aa  207  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  78.86 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  71.43 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  70.63 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  70.63 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  69.84 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  70.63 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  69.84 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  69.84 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  70.63 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  70.63 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  70.63 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  69.05 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  66.93 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  68.25 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  66.67 
 
 		 137 aa  186  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  68.8 
 
 		 129 aa  185  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  67.72 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 188 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  66.67 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  66.93 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  68.8 
 
 		 131 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  68.8 
 
 		 132 aa  182  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  65.35 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  65.87 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  65.87 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  64.57 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  62.1 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  64.34 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  64.34 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  63.57 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  62.3 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>