More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3845 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  99.17 
 
 		 120 aa  234  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  86.67 
 
 		 120 aa  207  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  85 
 
 		 120 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  82.5 
 
 		 120 aa  201  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  80.17 
 
 		 121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  77.87 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  57.02 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  46.67 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  47.5 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  41.88 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  45 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  52.21 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  45 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  41.8 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  43.75 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.18 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  43.75 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  43.75 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  44.17 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  40.98 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  44.17 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  44.17 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  45.13 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 385 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 385 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  44.17 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 386 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  42.61 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  43.36 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  40.98 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  38.33 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  42.98 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 188 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  39.5 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  45.05 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>