More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3595 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  70.83 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  67.5 
 
 		 298 aa  168  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  65.83 
 
 		 120 aa  163  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  60.83 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  58.12 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  39.83 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  42.5 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  42.74 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.5 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  41.46 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  41.03 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  41.03 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  41.03 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  46.3 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  37.4 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.4 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  37.5 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  41.03 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 266 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  36.29 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.83 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  37.19 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.89 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>