More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  100 
 
 		 119 aa  243  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  78.99 
 
 		 120 aa  190  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 120 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 298 aa  163  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  60.83 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  45 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  41.88 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  42.37 
 
 		 123 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  41.53 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  45.28 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  39.5 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  36.67 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  39.5 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.09 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  36.67 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  36.67 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.47 
 
 		 423 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  35.25 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  35 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  35 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  35 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  36.97 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  35 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  35 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  37.29 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  35 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35.83 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  35.77 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>