More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3585 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  63.25 
 
 
120 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  60.68 
 
 
120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  62.39 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  60.68 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  61.67 
 
 
122 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  61.34 
 
 
121 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  60.68 
 
 
120 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  58.26 
 
 
126 aa  139  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  55.83 
 
 
123 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  47.46 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  47.93 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
126 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  44.92 
 
 
121 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  43.44 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
122 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  45.76 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 
126 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
132 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  45.9 
 
 
126 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  43.9 
 
 
133 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  47.46 
 
 
130 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  43.9 
 
 
133 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 
128 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  47.46 
 
 
130 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  47.46 
 
 
130 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  44.26 
 
 
127 aa  104  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
126 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  41.8 
 
 
128 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  43.44 
 
 
126 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  43.44 
 
 
130 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  43.44 
 
 
130 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  49.14 
 
 
120 aa  103  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 
139 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
126 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
126 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  49.55 
 
 
122 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  44.26 
 
 
129 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  45.76 
 
 
125 aa  103  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  43.9 
 
 
133 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
120 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  44.26 
 
 
122 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  49.55 
 
 
122 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
127 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
129 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.8 
 
 
129 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
131 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 
127 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  43.44 
 
 
130 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  46.02 
 
 
120 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
128 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 
129 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  43.44 
 
 
130 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  41.8 
 
 
129 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  40.16 
 
 
128 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 
132 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 
129 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 
121 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 
129 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
129 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 
129 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  41.8 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  44.83 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 
131 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  39.34 
 
 
139 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
122 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  40.98 
 
 
148 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 
129 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
188 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  46.09 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  50 
 
 
131 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>