More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2000 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  69.92 
 
 		 123 aa  184  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  65.32 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  50.41 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  46.28 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  47.93 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  45.45 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  45.45 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  45.45 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  46.28 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  46.28 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  44.44 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  43.59 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  41.88 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  42.74 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  40.68 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  41.03 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  42.74 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  41.03 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  40.17 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  41.88 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  43.59 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  39.32 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  39.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  41.88 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  41.59 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  40.52 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  40.52 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  38.26 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.38 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  41.88 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>