More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1998 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  78.99 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  72.27 
 
 		 120 aa  177  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  65.55 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  63.87 
 
 		 298 aa  154  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 119 aa  103  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  41.03 
 
 		 120 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  39.67 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  39.67 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  42.06 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  37.82 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  38.02 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  37.19 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.52 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  37.19 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  37.19 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  37.19 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  37.19 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  36.07 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  35.77 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  36.07 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  37.19 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.02 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.88 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  35.54 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  33.88 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>