More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0325 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 120 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  67.5 
 
 		 120 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  63.33 
 
 		 119 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  63.87 
 
 		 120 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 122 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 120 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 120 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30860  hypothetical protein  48.73 
 
 		 163 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2316  hypothetical protein  41.29 
 
 		 158 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4998  hypothetical protein  42.58 
 
 		 166 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.66191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  39.66 
 
 		 120 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  95.5  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  41.22 
 
 		 130 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  41.22 
 
 		 130 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 120 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  41.22 
 
 		 130 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3594  hypothetical protein  38.96 
 
 		 158 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.529193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 119 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 126 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 126 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  38.71 
 
 		 123 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  41.41 
 
 		 125 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  40.32 
 
 		 121 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 126 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 126 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1997  hypothetical protein  37.34 
 
 		 168 aa  86.7  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.21 
 
 		 121 aa  86.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 120 aa  86.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 124 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 126 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  43.24 
 
 		 124 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.4 
 
 		 139 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  33.54 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  39.37 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  36.13 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 130 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  35.54 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  44.07 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  29.83 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  38.84 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 123 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 121 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 127 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.09 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 131 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  36.97 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  43.12 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  40.5 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>