More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4402 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  100 
 
 		 280 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  46.71 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  40.7 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  41.4 
 
 		 300 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  44.56 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  42.91 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  41.52 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  39.61 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  37.06 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  36.88 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 127 aa  102  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 126 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 130 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 406 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  40.34 
 
 		 121 aa  92  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  40.34 
 
 		 139 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 128 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 133 aa  89.4  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 124 aa  88.6  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 137 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 126 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.97 
 
 		 128 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  36.13 
 
 		 121 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 128 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 128 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  38.66 
 
 		 126 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  38.66 
 
 		 130 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  37.29 
 
 		 124 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  37.29 
 
 		 124 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 137 aa  86.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  36.13 
 
 		 128 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  34.88 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 125 aa  86.3  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  38.66 
 
 		 130 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 523 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 128 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 		 353 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 128 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 124 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 139 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 127 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 132 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  36.97 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  35.71 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  38.14 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 135 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  36.72 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  30.41 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  30.53 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1010 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  36.97 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  37.69 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  37.21 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  33.83 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  35.29 
 
 		 130 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  26.9 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>