More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5610 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  73.04 
 
 		 297 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  71.16 
 
 		 294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  68.87 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  68.87 
 
 		 294 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  68.24 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  68.87 
 
 		 296 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  68.12 
 
 		 302 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  62.38 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  61.76 
 
 		 300 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  40.13 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  37.58 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 127 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 135 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 130 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 128 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  40.65 
 
 		 124 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 127 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  40.32 
 
 		 128 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 124 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 126 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 128 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 128 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 126 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 127 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  42.4 
 
 		 127 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  42.4 
 
 		 131 aa  99.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  40.32 
 
 		 128 aa  99  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.4 
 
 		 127 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 126 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 123 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 129 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 123 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 129 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 126 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 127 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  40.32 
 
 		 127 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  40.48 
 
 		 148 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.27 
 
 		 129 aa  96.3  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 126 aa  95.9  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  38.21 
 
 		 124 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  38.21 
 
 		 128 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 126 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 127 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 139 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  41.13 
 
 		 127 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 129 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  39.02 
 
 		 130 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.9 
 
 		 126 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  42.4 
 
 		 129 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  39.52 
 
 		 126 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 126 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 132 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 122 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  41.6 
 
 		 129 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.89 
 
 		 131 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  41.6 
 
 		 129 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  41.6 
 
 		 129 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 129 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 129 aa  92.4  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 131 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 126 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 		 132 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 137 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 128 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  37.6 
 
 		 131 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  37.4 
 
 		 130 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  38.89 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  37.4 
 
 		 130 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 131 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 132 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>