More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3825 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  43.6 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  42.66 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  40.56 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  43 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  40.14 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  35.86 
 
 		 318 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  36.33 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  37.15 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 127 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 130 aa  105  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 128 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 127 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  41.94 
 
 		 128 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 129 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 127 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 129 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 131 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 128 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  41.46 
 
 		 137 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 128 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 131 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 131 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 127 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 124 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  42.98 
 
 		 131 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 128 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 126 aa  99  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 129 aa  98.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 126 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 		 129 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  42.15 
 
 		 131 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  44.92 
 
 		 139 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 127 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 127 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 126 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 129 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 127 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 128 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  39.52 
 
 		 128 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  38.58 
 
 		 130 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  38.58 
 
 		 130 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  39.52 
 
 		 127 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 126 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 131 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  44.44 
 
 		 121 aa  97.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  39.52 
 
 		 124 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 139 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  39.52 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 133 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  39.52 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  40.65 
 
 		 130 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  38.71 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  40.65 
 
 		 126 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  39.52 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  42.15 
 
 		 129 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 126 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  41.46 
 
 		 122 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  42.98 
 
 		 127 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 126 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 123 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 126 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  39.52 
 
 		 128 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 126 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 126 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 131 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  36.29 
 
 		 139 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 119 aa  95.9  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 124 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  40.65 
 
 		 130 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 127 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 132 aa  95.5  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  38.71 
 
 		 127 aa  95.5  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 123 aa  95.5  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  38.71 
 
 		 129 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>