More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3598 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  40.47 
 
 
297 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  43.05 
 
 
300 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  42.37 
 
 
300 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  39.35 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  41.61 
 
 
294 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  40.47 
 
 
294 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  40.14 
 
 
280 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  39.73 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  40.8 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  40.13 
 
 
300 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
288 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  40.53 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  42.27 
 
 
283 aa  208  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
127 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  43.44 
 
 
139 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  40.98 
 
 
121 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  40.16 
 
 
121 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
126 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 
130 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 
130 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 
130 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
125 aa  96.3  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
137 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
126 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 
124 aa  93.2  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
126 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
126 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.59 
 
 
130 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
126 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
131 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
126 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 
128 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
351 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  38.79 
 
 
120 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  34.43 
 
 
128 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
139 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  34.43 
 
 
128 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  34.43 
 
 
124 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  32.54 
 
 
126 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  33.61 
 
 
124 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35.25 
 
 
130 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.25 
 
 
126 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 
122 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  35.25 
 
 
130 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
128 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 
127 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
128 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
126 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
124 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 
229 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
128 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
126 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  36.89 
 
 
132 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
129 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  31.97 
 
 
126 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
129 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
133 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  36.13 
 
 
131 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  39.02 
 
 
131 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
122 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
122 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
129 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
127 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
129 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
127 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
135 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  33.07 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
127 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
127 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  33.61 
 
 
130 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 
132 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  33.61 
 
 
127 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  33.61 
 
 
130 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  37.19 
 
 
129 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  34.86 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  34.86 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  35.9 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  36.52 
 
 
124 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.51 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  29.51 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  34.96 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  34.43 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>