More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3942 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  98.87 
 
 
265 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  98.87 
 
 
265 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  98.87 
 
 
265 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  89.06 
 
 
265 aa  487  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  85.66 
 
 
265 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  86.04 
 
 
265 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  84.53 
 
 
267 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  82.26 
 
 
265 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  78.11 
 
 
265 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  78.11 
 
 
265 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  77.36 
 
 
265 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  75.76 
 
 
266 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  72.83 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  51.92 
 
 
266 aa  271  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  49.42 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  47.47 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  56.31 
 
 
209 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  41.8 
 
 
266 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 
131 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
129 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  37.7 
 
 
127 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
132 aa  99  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
129 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
129 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
129 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 
127 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  35.25 
 
 
130 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  35.25 
 
 
130 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
126 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35.25 
 
 
130 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.25 
 
 
126 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  36.89 
 
 
135 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.89 
 
 
127 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  36.67 
 
 
122 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  37.7 
 
 
127 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  36.89 
 
 
127 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
139 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 
127 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  35.77 
 
 
128 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 
128 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
127 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
127 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  35.25 
 
 
130 aa  95.9  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  35.77 
 
 
127 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  34.96 
 
 
131 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.61 
 
 
128 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
123 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
123 aa  95.5  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.89 
 
 
127 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 
139 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  34.17 
 
 
124 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.7 
 
 
127 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  36.36 
 
 
131 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 
131 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  35.77 
 
 
129 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  40.83 
 
 
139 aa  93.6  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
131 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
131 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
188 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 
129 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  37.01 
 
 
133 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
131 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  37.01 
 
 
133 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.33 
 
 
148 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 
125 aa  92.4  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
128 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
128 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 
129 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 
129 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 
129 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
132 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
124 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
124 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  32.79 
 
 
128 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 
130 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
126 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
128 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
593 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
128 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 
130 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>