More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0555 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  43.02 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  42.13 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  41.63 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  41.5 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  45.1 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  44.55 
 
 		 129 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  44.55 
 
 		 129 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  44.55 
 
 		 129 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 129 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 129 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 129 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  44.44 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.59 
 
 		 129 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 127 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 1014 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.6 
 
 		 131 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1936 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 131 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 130 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 133 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  42.59 
 
 		 129 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  42.59 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  37.72 
 
 		 127 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 128 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  36.84 
 
 		 127 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  37.17 
 
 		 148 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  40.54 
 
 		 131 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 135 aa  85.5  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 132 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  30.43 
 
 		 1937 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35.96 
 
 		 130 aa  85.5  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1937 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.96 
 
 		 126 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 131 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.5 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 129 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 126 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 139 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 131 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  35.59 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 126 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  28.22 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>