More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01714 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  71.98 
 
 		 266 aa  305  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  57.77 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  59.22 
 
 		 265 aa  257  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  57.28 
 
 		 265 aa  257  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  57.28 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 266 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  57.77 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  57.69 
 
 		 265 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  58.74 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  56.31 
 
 		 265 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  56.31 
 
 		 265 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  56.31 
 
 		 265 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  56.31 
 
 		 265 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  54.37 
 
 		 265 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  54.59 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  48.56 
 
 		 265 aa  211  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  49.75 
 
 		 265 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  45.1 
 
 		 266 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 127 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 132 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1203  response regulator of chemotaxis  40.5 
 
 		 123 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.266578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 126 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.06 
 
 		 139 aa  90.5  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 139 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  36.67 
 
 		 131 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35.83 
 
 		 122 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.71 
 
 		 130 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.52 
 
 		 121 aa  86.7  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.71 
 
 		 126 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  36.07 
 
 		 130 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 130 aa  85.9  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  36.07 
 
 		 130 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.43 
 
 		 130 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.51 
 
 		 133 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  36.67 
 
 		 131 aa  84.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  84.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  34.43 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 129 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 129 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  35.25 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  38.53 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.51 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  37.84 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  35.83 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  35.25 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  32.5 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>