More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0601 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  81.89 
 
 		 265 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  78.87 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  80.38 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  78.49 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  78.11 
 
 		 265 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  76.6 
 
 		 267 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  76.6 
 
 		 265 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  77.74 
 
 		 265 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  77.74 
 
 		 265 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  77.74 
 
 		 265 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  77.36 
 
 		 265 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  78.03 
 
 		 266 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  73.96 
 
 		 265 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  48.66 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  58.74 
 
 		 209 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  40.94 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 129 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 129 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 		 131 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 132 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  36.59 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  36.59 
 
 		 129 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 127 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 119 aa  95.9  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 131 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 135 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.71 
 
 		 126 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  36.36 
 
 		 131 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 139 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  40.16 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.71 
 
 		 130 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 131 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  33.61 
 
 		 130 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35 
 
 		 122 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  40.83 
 
 		 121 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  33.61 
 
 		 130 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 127 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  40.74 
 
 		 128 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 124 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 128 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  39.17 
 
 		 121 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 188 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.61 
 
 		 128 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.43 
 
 		 130 aa  92.8  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 139 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  33.88 
 
 		 124 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 123 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 129 aa  92.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 133 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 133 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 123 aa  92  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 132 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 127 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  92  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  38.33 
 
 		 130 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  38.33 
 
 		 130 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>