More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1591 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  100 
 
 		 266 aa  536  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  71.98 
 
 		 209 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  52.31 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  52.63 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  52.45 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 265 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  52.51 
 
 		 265 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  51.54 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  51.15 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  47.88 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  44.53 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 127 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 130 aa  92.8  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 131 aa  92  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 127 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 127 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  37.9 
 
 		 126 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 127 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 127 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 132 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 127 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  38.52 
 
 		 122 aa  89.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 127 aa  89  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 130 aa  89  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  38.71 
 
 		 127 aa  89  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 123 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 129 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 129 aa  88.6  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 135 aa  88.6  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 129 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 123 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 129 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  37.1 
 
 		 130 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  37.1 
 
 		 130 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 133 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 133 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 128 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 126 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 826 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 139 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 131 aa  85.5  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  38.53 
 
 		 129 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  38.53 
 
 		 129 aa  85.5  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  37.39 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 126 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  38.53 
 
 		 139 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.94 
 
 		 133 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.89 
 
 		 131 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 1771 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  29.63 
 
 		 1287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  38.05 
 
 		 124 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.55 
 
 		 1331 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  36.7 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  41.67 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1203  response regulator of chemotaxis  38.89 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.266578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 		 784 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  37.61 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  37.61 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  37.61 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  36.7 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  36.7 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.87 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  36.7 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  36.7 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  36.7 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  37.17 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.82 
 
 		 134 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  36.67 
 
 		 1378 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>